La colección José Manuel Villalpando está integrada por 5 mil ejemplares divididos entre Pedagogía y Filosofía. En la sección de Pedagogía, se pueden consultar prácticamente la totalidad de publicaciones del Dr. Francisco Larroyo, así como las obras de los grandes pedagogos universales: Pestalozzi, García Hoz, Juan Luis Vives, Piaget y Freire.
La colección de Filosofía está compuesta por las obras de los clásicos grecorromanos, desde Aristóteles, Platón, Euclides, hasta Séneca, Plotino, Tito Lucrecio, entre otros.